• Complex
  • Title
  • Keyword
  • Abstract
  • Scholars
  • Journal
  • ISSN
  • Conference
成果搜索

author:

郑燕钗 (郑燕钗.) [1] | 王育婷 (王育婷.) [2] | 王凌 (王凌.) [3]

Abstract:

目的 筛选急性心肌梗死(acute myocardial infarction,AMI)的核心基因,并预测相应基因的潜在治疗药物.方法 从基因表达数据库(gene expression omnibus,GEO)中下载数据集GSE24519与GSE66360,筛选AMI与正常对照组的差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),进行基因本体(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析,通过String、Cytoscape构建蛋白质-蛋白质相互作用网络,应用cytoHubba插件筛选出核心基因,并与DGIdb数据库相映射,揭示尚未被充分挖掘的、可能用于治疗AMI的药物靶点及潜在药物候选.结果 2 组数据集中共有 43 个基因被鉴定为交集DEGs(P<0.05),包括 33 个上调基因,10 个下调基因;GO分析生物过程主要富集在细胞分化、细胞群增殖的正调控、丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinases,MAPK)活性的负调控、细胞因子产生的正调控等;KEGG通路富集分析显示DEGs主要参与了晚期糖基化终末产物-晚期糖基化终末产物受体信号通路、MAPK信号通路等.通过cytoHubba筛选获得5个核心基因(RGS2、DUSP1、JUN、LRRK2、TNFAIP6),用DGIdb数据库预测这些基因相对应的潜在治疗药物,共获得了 87 个药物或化合物.其中RGS2、DUSP1、JUN及LRRK2 分别获得 1、15、46 和 25 个药物或化合物,而TNFAIP6并未被预测到相应治疗药物.结论 RGS2、DUSP1、JUN、LRRK2、TNFAIP6 是AMI发生发展的核心基因;基于数据库预测的靶向DUSP1 的羟基脲、伊马替尼,靶向JUN的秋水仙碱以及靶向LRRK2 的帕博西尼等药物在治疗AMI方面具有潜在的治疗价值.

Keyword:

差异基因 急性心肌梗死 生物信息学 药物预测

Community:

  • [ 1 ] [王育婷]福建医科大学
  • [ 2 ] [郑燕钗]福建省福州市长乐区人民医院 药剂科,福建 福州 350200
  • [ 3 ] [王凌]福州大学附属省立医院药学部,福建 福州 350001

Reprint 's Address:

Email:

Show more details

Related Keywords:

Source :

创伤与急诊电子杂志

ISSN: 2095-5316

Year: 2024

Issue: 3

Volume: 12

Page: 203-211

Cited Count:

WoS CC Cited Count:

SCOPUS Cited Count:

ESI Highly Cited Papers on the List: 0 Unfold All

WanFang Cited Count:

Chinese Cited Count:

30 Days PV: 1

Online/Total:516/10205409
Address:FZU Library(No.2 Xuyuan Road, Fuzhou, Fujian, PRC Post Code:350116) Contact Us:0591-22865326
Copyright:FZU Library Technical Support:Beijing Aegean Software Co., Ltd. 闽ICP备05005463号-1