交通运输业能耗强度与各行业平均水平的差距逐步扩大，使得交通运输业逐步成为节能环保的短板之一.在此背景下，利用随机前沿模型，以中国30省区为样本，测算1995—2012年各地区交通运输业全要素能源效率并进行影响因素分析.结果表明，全要素视角下的中国交通运输业能源效率总体呈扁平W型走势波动上升，平均有56.3%的节能潜力；东中西部地区差异明显，呈现自东向西逐步下降的空间格局；全要素评价结果比单要素能源效率更加稳健；各省区交通运输业能源效率在2004—2012年以年均9.6%的速度发散，其中西部地区年均发散速率达到10.7%；对外开放、工业化进程、人力资本显著促进交通运输业能源效率的提升，制度因素与政府干预抑制作用明显，基础设施水平的影响不显著.