为了保护综合能源系统中不同运营主体的信息隐私，权衡系统运行低碳性和经济性，解决天然气网络鲁棒模型难以求解的问题，提出了考虑碳-绿证耦合机制的电-气-热综合能源系统分布式鲁棒低碳经济调度方法。考虑天然气网络和热力网络的动态特性、碳-绿证耦合机制，构建综合能源系统动态低碳经济调度模型；为了保护各网络运营商的数据隐私，根据能量耦合关系对综合能源系统解耦，建立电-气-热网络的分布式协同优化模型；在此基础上，考虑风电出力和多能负荷的不确定性，提出基于一致性交替方向乘子法的分布式鲁棒优化框架，并利用二阶锥对偶理论与交替优化方法实现含二阶锥约束和二元变量的鲁棒子问题求解。以修改的IEEE　39节点电力网络、比利时20节点天然气网络和15节点热力网络为算例进行仿真分析，验证所提方法能够在源荷不确定性条件下实现综合能源系统各网络分散自治运行，同时兼顾系统运行的低碳性和经济性。