目的　本研究旨在建立福建灵芝高效薄层色谱方法，并对比福建产区与其他产区薄层的异同点，为灵芝药材在薄层溯源中的应用提供实验依据。方法　采用Merk　HPTLC　Silica　gel　60预制板，氯仿-乙腈-甲醇-甲酸(13∶1.5∶0.2∶0.2)为展开剂，3%硫酸乙酸乙酯溶液显色，在紫外366　nm下检视，采用对照品比对鉴别薄层色谱条带。使用斑点条带数字化表征，对不同产区样品进行聚类分析。结果　高效薄层色谱共分离灵芝药材中17个条带，用对照品比对鉴定了其中11个成分，包括灵芝烯酸C(Rf_5=0.31)、灵芝酸C2(Rf_6=0.33)、灵芝酸I(Rf_7=0.35)、灵芝酸G(Rf_8=0.41)、灵芝酸A(Rf_9=0.44)、灵芝酸B(Rf_(10)=0.46)、灵芝内酯B(Rf_(11)=0.53)、3β,7β,15β-三羟基-11,15-二羰基-羊毛甾烷-8-烯-24→20内酯(Rf_(12)=0.56)、灵芝烯酸D(Rf_(13)=0.61)、灵芝酸D(Rf_(14)=0.63)和20(21)-脱氢赤芝酸A(Rf_(15)=0.65)。福建灵芝共鉴别10个条带，其中未知成分(Rf_1=0.14;Rf_2=0.17)、灵芝酸C2和灵芝烯酸D　4个条带是其差异标志物。不同产区灵芝在薄层特征图谱上存有差异。聚类分析当欧式距离为25时，灵芝样本可以被区分为福建产区和其他产区两类。结论　建立的高效薄层图谱方法简便、特征明显，可应用于福建灵芝的质量追溯，可为福建灵芝的道地追溯提供一种新的高效薄层色谱技术手段。