建立了快速分离和检测引起仔猪腹泻的肠毒性大肠杆菌K88、K99和987P细菌细胞的毛细管区带电泳方法,并进行了腹泻仔猪粪便中肠毒性大肠杆菌的应用检测分析。结果表明,在电泳缓冲液为0.05　mol/L　Na2CO3-NaHCO3(pH9.9)、分离电压为14.1　kV、检测波长为210nm的电泳条件下,E.coli　K88、K99和987P的细胞分别具有单一、稳定的特征谱峰,其保留时间的相对标准偏差RSD≤0.9%;在确定的实验条件下,实现了腹泻仔猪粪便中肠毒性大肠杆菌的快速检测分析,发现将出生5d-6d的腹泻仔猪粪便引入培养基中增殖后主要检出K88,将出生30d-35d的腹泻仔猪粪便引入培养基中增殖后主要检出K99,将出生60d左右的腹泻仔猪粪便引入培养基中增殖后未发现肠毒性大肠杆菌。