本文建立制度间关系模型对我国航空运输业的结构性壁垒进行分析。研究发现。民营经济进入航空运输业的结构性壁垒以替代关系为主,其中社会习俗、伦理等所形成的松散层内在制度进入壁垒对民航相关法规、反垄断法、行政法和行政诉讼法所形成的外在制度进入壁垒形成了替代,后者又对核心层的内在制度进入壁垒形成了替代:互补关系的结构性壁垒次之。其中行业协会、新闻媒体构成的紧密层内在制度进入壁垒与外在制度进入壁垒形成了互补,后者又与人治和法治共存的社会规则形成互补:中性关系的结构性壁垒所占比重最少。研究提出,应重视进入壁垒间的替代与互补关系。通过制度组合和制度传导,以及正确的制度改革顺序以寻求降低民营经济进入航空运输业的结构性壁垒的路径。