A　microemulsion　electrokinetic　capillary　(MEEKC)　chromatography　method　was　online-coupled　with　field-amplified　sample　injection　(FASI)　for　the　analysis　of　nucleosides　and　nucleobases,　namely　cytidine,　guanosine,　N6-methyladenosine,　fluorouracil,　thymine,　adenine,　mercaptopurine,　6-hydroxypurine,　and　guanine.　A　microemulsion　background　electrolyte　containing　10　mM　sodium　dodecyl　sulfate　(SDS),　0.6%　(v/v)　1-butanol,　0.5%　(v/v)　ethyl　acetate　and　98.9%　(v/v)　borate　buffer　(10　mM;　pH　9.0)　was　used　as　the　running　buffer.　An　online　field-amplified　sample　injection　(FASI)　technique　was　adopted　to　improve　the　detection　sensitivity.　Baseline　separation　of　nine　nucleosides　was　achieved　within　12　min　with　detection　limits　(S/N　=　3)　between　0.22　and　2.97　μg　mL-1　with　the　DAD　detector　at　200　nm　under　optimized　conditions.　The　proposed　method　was　applied　to　the　determination　of　nine　nucleoside　compounds　in　spiked　urine　and　serum　samples　with　the　recoveries　ranging　91.2-113%　and　85.2-112%　and　the　relative　standard　deviations　(RSDs,　n　=　3)　at　less　than　5.90%　and　8.22%,　respectively.　©　The　Royal　Society　of　Chemistry　2015.