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姜莉 (姜莉.) [1] | 李玉榕 (李玉榕.) [2] (Scholars:李玉榕)

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生物医学研究揭示,肿瘤抑制基因p53的表达水平与肿瘤的形成相关.p53相关的信号转导网络研究为揭示癌症、肿瘤的发病机制和寻找其治疗方法提供新思路,而p53和癌基因Mdm2的负反馈关系是该信号转导网络的核心部分.因此,研究p53-Mdm2的调控关系意义重大.基于电离辐射后人类白血病细胞中测得的时间序列基因表达数据,利用连续-离散的扩展卡尔曼(EKF)算法,建立带有延迟特性的非线性动态连续随机生物网络模型,模拟电离辐射后的p53-Mdm2动态调控过程.同时,对所建立网络的准确性进行验证,可得模型的误差率为0.85%.结果表明:所提出的算法是收敛的,可以预测基因的表达水平,准确地模拟p53-Mdm2调控网络受到电离辐射后的衰减震荡响应过程,该过程和生物实验结果一致.所提出的算法为生物学实验建模提供一种有效的方法,并可以为网络系统动力学特性的研究提供条件.

Keyword:

p53-Mdm2网络 延迟 时间序列数据 连续-离散扩展卡尔曼(EKF)算法

Community:

  • [ 1 ] [姜莉]福州大学电气工程与自动化学院,福州350116 ;福州大学福建省医疗器械和医药技术重点实验室,福州350116
  • [ 2 ] [李玉榕]福州大学电气工程与自动化学院,福州350116 ;福州大学福建省医疗器械和医药技术重点实验室,福州350116

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Source :

中国生物医学工程学报

ISSN: 0258-8021

CN: 11-2057/R

Year: 2017

Issue: 2

Volume: 36

Page: 180-186

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